微生物工程与技术研究院以工农业生产及环境保护可持续发展直接相关的微生物技术为研究对象，开发利用微生物功能的新工艺、新技术，致力以解决相关行业实际生产中的关键性问题，并使其达到工程化应用及推广水平。目前已在绿色农业生产、环境治理修复、资源循环利用等领域取得一系列应用成果。
在绿色农业生产领域，采用生物菌肥与微生物强化相结合的方式，研究开发富含功能微生物菌群的多种形式生物菌肥体系。获三种国家肥料证书，在四川、陕西、山东等地的苹果、大棚甜瓜、红枣、猕猴桃种植等推广应用。生物膜替代苹果套袋技术，获得陕西省科技创新工程和科技部农业科技成果转化项目，技术通过省级鉴定，在陕西省洛川、白水推广苹果种植应用面积5000亩以上。2020-2021年应用该套技术在神木四县实施了1000亩红枣防裂果实验，效果明显。
图1 生物膜替代套袋（左）与套袋（右）栽培对
图2 生物膜免套袋苹果生长情况
在环境治理修复领域，采用微生物工程技术综合治理盐碱土地、水体，在榆林地区完成250亩盐碱地修复；完成30000立方红碱淖盐碱水体生态修复；研究微生物工程技术修复石油污染，技术于2011年获陕西省科技进步二等奖，在新疆、内蒙、山东、陕西等油田应用该技术累计处理含油污泥十余万吨。
图3 微生物工程技术修复红碱淖盐碱水体实验池情况
图4 榆林地区盐碱荒地改造过程
图5 改造后盐碱地种植的作物生长情况
在资源循环利用领域，研制了城市污泥无害化及资源化处置的工艺及成套设备，技术通过省级鉴定，在西安市第六污水厂建成日处理300吨示范工程项目，累计处理城市污泥超过20万吨；利用微生物工程技术转化农副产品加工废弃物为生物活性饲料，相关研发产品已在山东建成年产10万吨的生产线并投产运行。
图6 西安市第六污水厂城市污泥的无害化与资源化处理处置示范工程
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